Los conspiradores de Querétaro fueron descubiertos por las fuerzas peninsulares por lo que se vieron forzados a recurrir a las armas para enfrentarlos. Como el grupo de criollos no contaba con un apoyo de base, en la madrugada del 16 de septiembre de 1810, Miguel Hidalgo, ofreció una misa en la cual solicitó a los asistentes a rebelarse contra el régimen virreinal.
La rebelión alcanzó el apoyo popular debido al malestar social contra el gobierno español y las crudas consecuencias que este había provocado en la sociedad novohispana como desigualdad y explotación.
El avance de los insurgentes les permitió llegar hacia las ciudades más importantes del Bajío incluso alcanzando Ciudad de México, momento en el cual, por solicitud de Hidalgo se genera un retroceso.
El 30 de octubre de 1810, los insurgentes lograron un triunfo en la Batalla del Monte de las Cruces, tras lo cual, Hidalgo declaró públicamente que las tierras comunales deberían ser de los indígenas así también abolió la esclavitud y el tributo indígena.
En los siguientes enfrentamientos, el ejército español (conocido ya como realista) adquirió una ventaja sobre los insurgentes. Las diferencias entre Hidalgo y Allende se agudizaron tras las consecutivas derrotas.
Al año siguiente, el 17 de enero, las fuerzas virreinales lograron derrotar a los insurgentes causando la huida hacia el norte de Hidalgo y el resto de los insurgentes. En las provincias norteñas encontraron apoyo ya que aquí también se habían iniciado un conflicto armado.
Finalmente, los líderes insurgentes fueron capturados por los realistas en Acatita de Baján, Coahuila y trasladados a Chihuahua siendo fusilados. Sus cabezas fueron expuestas en las esquinas de Alhóndiga de Granaditas en Guanajuato.
Este levantamiento marcó el inicio de la lucha armada por la Independencia de México que fue coronada con el triunfo del Ejército Trigarante el día 27 de septiembre de 1921, tras ingresar exitosamente a Ciudad de México.
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